FATAL: could not load modules.dep

Собственно обновил до 2.6.35-23 - и то же самое;(

Такое появлялось после обновления на 10.10, но т.к. система сама по себе обновилась криво, то разбираться не стал, переставил на 10.10 x64, проблем вообще никаких.

Есть одно предположение...
сам по себе этот файл возникает после команды от руа depmod -a
запустите ее, и посмотрите вывод... В консоли, разумеется.
Его можно вытереть, и после депмода он появится снова, если у вас в системе стоит все, что нужно. :-)
root@dyug-1010:~# ls -la /lib/modules/2.6.35-23-generic/
итого 4036
drwxr-xr-x  4 root root   4096 2010-10-30 20:31 .
drwxr-xr-x  4 root root   4096 2010-10-30 20:30 ..
lrwxrwxrwx  1 root root     40 2010-10-30 20:31 build -> /usr/src/linux-headers-2.6.35-23-generic
drwxr-xr-x  2 root root   4096 2010-10-27 00:28 initrd
drwxr-xr-x 10 root root   4096 2010-10-30 20:30 kernel
-rw-r--r--  1 root root 640982 2010-10-30 20:31 modules.alias
-rw-r--r--  1 root root 620851 2010-10-30 20:31 modules.alias.bin
-rw-r--r--  1 root root   5527 2010-10-27 00:26 modules.builtin
-rw-r--r--  1 root root   6753 2010-10-30 20:31 modules.builtin.bin
-rw-r--r--  1 root root     69 2010-10-30 20:31 modules.ccwmap
-rw-r--r--  1 root root 299728 2010-10-30 20:31 modules.dep
-rw-r--r--  1 root root 439389 2010-10-30 20:31 modules.dep.bin
-rw-r--r--  1 root root    135 2010-10-30 20:31 modules.devname
-rw-r--r--  1 root root   1405 2010-10-30 20:31 modules.ieee1394map
-rw-r--r--  1 root root    218 2010-10-30 20:31 modules.inputmap
-rw-r--r--  1 root root  21047 2010-10-30 20:31 modules.isapnpmap
-rw-r--r--  1 root root     74 2010-10-30 20:31 modules.ofmap
-rw-r--r--  1 root root 116673 2010-10-27 00:26 modules.order
-rw-r--r--  1 root root 424614 2010-10-30 20:31 modules.pcimap
-rw-r--r--  1 root root   1681 2010-10-30 20:31 modules.seriomap
-rw-r--r--  1 root root    131 2010-10-30 20:31 modules.softdep
-rw-r--r--  1 root root 239686 2010-10-30 20:31 modules.symbols
-rw-r--r--  1 root root 308285 2010-10-30 20:31 modules.symbols.bin
-rw-r--r--  1 root root 935416 2010-10-30 20:31 modules.usbmap
root@dyug-1010:~# depmod -a
root@dyug-1010:~# ls -la /lib/modules/2.6.35-23-generic/
итого 4036
drwxr-xr-x  4 root root   4096 2010-10-31 09:24 .
drwxr-xr-x  4 root root   4096 2010-10-30 20:30 ..
lrwxrwxrwx  1 root root     40 2010-10-30 20:31 build -> /usr/src/linux-headers-2.6.35-23-generic
drwxr-xr-x  2 root root   4096 2010-10-27 00:28 initrd
drwxr-xr-x 10 root root   4096 2010-10-30 20:30 kernel
-rw-r--r--  1 root root 640982 2010-10-31 09:24 modules.alias
-rw-r--r--  1 root root 620851 2010-10-31 09:24 modules.alias.bin
-rw-r--r--  1 root root   5527 2010-10-27 00:26 modules.builtin
-rw-r--r--  1 root root   6753 2010-10-31 09:24 modules.builtin.bin
-rw-r--r--  1 root root     69 2010-10-31 09:24 modules.ccwmap
-rw-r--r--  1 root root 299728 2010-10-31 09:24 modules.dep
-rw-r--r--  1 root root 439389 2010-10-31 09:24 modules.dep.bin
-rw-r--r--  1 root root    135 2010-10-31 09:24 modules.devname
-rw-r--r--  1 root root   1405 2010-10-31 09:24 modules.ieee1394map
-rw-r--r--  1 root root    218 2010-10-31 09:24 modules.inputmap
-rw-r--r--  1 root root  21047 2010-10-31 09:24 modules.isapnpmap
-rw-r--r--  1 root root     74 2010-10-31 09:24 modules.ofmap
-rw-r--r--  1 root root 116673 2010-10-27 00:26 modules.order
-rw-r--r--  1 root root 424614 2010-10-31 09:24 modules.pcimap
-rw-r--r--  1 root root   1681 2010-10-31 09:24 modules.seriomap
-rw-r--r--  1 root root    131 2010-10-31 09:24 modules.softdep
-rw-r--r--  1 root root 239686 2010-10-31 09:24 modules.symbols
-rw-r--r--  1 root root 308285 2010-10-31 09:24 modules.symbols.bin
-rw-r--r--  1 root root 935416 2010-10-31 09:24 modules.usbmap
root@dyug-1010:~#
Я думаю, поможет...